Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMO75781 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALMO75781 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALMO75781 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALMO75781 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALMO75781 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALMO75781 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALMO75781 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALMO75781 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALMO75781 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALMO75781 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALMO75781 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALMO75781 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALMO75781 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALMO75781 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALMO75781 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALMO75781 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALMO75781 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALMO75781 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALMO75781 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALMO75781 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALMO75781 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALMO75781 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALMO75781 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALMO75781 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALMO75781 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALMO75781 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMO75781 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALMO75781 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PALMO75781 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALMO75781 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALMO75781 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMO75781 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMO75781 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMO75781 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms