Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMPCBO75439 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms