Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS26AO75436 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS26AO75436 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms