Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
PLXNC1O60486 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PLXNC1O60486 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PLXNC1O60486 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PLXNC1O60486 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms