Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF1CO43896 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF1CO43896 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms