Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSNA1O43805 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSNA1O43805 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms