Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR1O43759 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR1O43759 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR1O43759 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms