Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAB2O43741 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAB2O43741 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKAB2O43741 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms