Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB2O43679 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB2O43679 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB2O43679 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB2O43679 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB2O43679 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB2O43679 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB2O43679 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB2O43679 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB2O43679 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB2O43679 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB2O43679 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB2O43679 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB2O43679 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB2O43679 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB2O43679 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDB2O43679 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LDB2O43679 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDB2O43679 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB2O43679 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB2O43679 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB2O43679 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB2O43679 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB2O43679 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB2O43679 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB2O43679 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB2O43679 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDB2O43679 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDB2O43679 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LDB2O43679 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDB2O43679 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LDB2O43679 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms