Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROM1O43490 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROM1O43490 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROM1O43490 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROM1O43490 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROM1O43490 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROM1O43490 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROM1O43490 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROM1O43490 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROM1O43490 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROM1O43490 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROM1O43490 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM1O43490 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM1O43490 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM1O43490 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM1O43490 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM1O43490 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROM1O43490 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM1O43490 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM1O43490 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROM1O43490 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROM1O43490 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROM1O43490 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROM1O43490 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PROM1O43490 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PROM1O43490 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROM1O43490 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROM1O43490 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROM1O43490 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms