Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COCHO43405 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COCHO43405 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COCHO43405 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COCHO43405 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COCHO43405 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COCHO43405 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COCHO43405 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COCHO43405 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COCHO43405 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COCHO43405 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COCHO43405 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COCHO43405 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COCHO43405 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COCHO43405 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COCHO43405 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COCHO43405 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COCHO43405 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COCHO43405 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COCHO43405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COCHO43405 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COCHO43405 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COCHO43405 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COCHO43405 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COCHO43405 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COCHO43405 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COCHO43405 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COCHO43405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COCHO43405 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COCHO43405 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COCHO43405 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COCHO43405 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COCHO43405 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COCHO43405 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COCHO43405 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COCHO43405 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COCHO43405 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms