Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSI1O43347 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSI1O43347 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSI1O43347 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSI1O43347 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSI1O43347 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSI1O43347 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSI1O43347 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSI1O43347 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSI1O43347 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSI1O43347 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSI1O43347 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSI1O43347 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSI1O43347 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSI1O43347 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSI1O43347 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSI1O43347 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSI1O43347 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSI1O43347 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MSI1O43347 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSI1O43347 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSI1O43347 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSI1O43347 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSI1O43347 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSI1O43347 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSI1O43347 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSI1O43347 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSI1O43347 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSI1O43347 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSI1O43347 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSI1O43347 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSI1O43347 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSI1O43347 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSI1O43347 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSI1O43347 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSI1O43347 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSI1O43347 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSI1O43347 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSI1O43347 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSI1O43347 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSI1O43347 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSI1O43347 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSI1O43347 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSI1O43347 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSI1O43347 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSI1O43347 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSI1O43347 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSI1O43347 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSI1O43347 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSI1O43347 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSI1O43347 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSI1O43347 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSI1O43347 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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