Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPSS1O43252 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPSS1O43252 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms