Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCF2LO15068 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCF2LO15068 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms