Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDKO14874 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDKO14874 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms