Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms