Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
O00370 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
O00370 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
O00370 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
O00370 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
O00370 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
O00370 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
O00370 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
O00370 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
O00370 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
O00370 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
O00370 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
O00370 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
O00370 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
O00370 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
O00370 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
O00370 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
O00370 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
O00370 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
O00370 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
O00370 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
O00370 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
O00370 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
O00370 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
O00370 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
O00370 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
O00370 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
O00370 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
O00370 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
O00370 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
O00370 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
O00370 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
O00370 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
O00370 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
O00370 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
O00370 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
O00370 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
O00370 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
O00370 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
O00370 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms