Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3CDO00329 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3CDO00329 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3CDO00329 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms