Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR4O00206 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR4O00206 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR4O00206 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR4O00206 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR4O00206 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR4O00206 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR4O00206 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR4O00206 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR4O00206 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR4O00206 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR4O00206 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR4O00206 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR4O00206 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR4O00206 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR4O00206 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR4O00206 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR4O00206 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR4O00206 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR4O00206 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR4O00206 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR4O00206 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR4O00206 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR4O00206 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR4O00206 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR4O00206 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR4O00206 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR4O00206 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR4O00206 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR4O00206 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR4O00206 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR4O00206 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR4O00206 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR4O00206 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR4O00206 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR4O00206 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR4O00206 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms