Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVH48-1M5A8F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVH48-1M5A8F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVH48-1M5A8F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms