Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01387J3KSC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms