Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4DXG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DXG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DXG7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
B4DXG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DXG7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DXG7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DXG7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DXG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DXG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DXG7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DXG7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DXG7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DXG7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DXG7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DXG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DXG7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DXG7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DXG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DXG7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DXG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DXG7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DXG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DXG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DXG7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DXG7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DXG7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms