Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNCNA6PVL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms