Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL13PA6NNM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms