Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RGPD3A6NKT7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RGPD3A6NKT7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms