Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR42E2A6NKP2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR42E2A6NKP2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms