Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A20A6NK97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A20A6NK97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A20A6NK97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms