Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NPIPB13A6NJU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB13A6NJU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB13A6NJU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms