Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRN3P2A6NIE6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3P2A6NIE6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms