Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf60A6NFR6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf60A6NFR6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms