Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABD2BA6NFA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRABD2BA6NFA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms