Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A6NDN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A6NDN8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NDN8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
A6NDN8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NDN8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A6NDN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NDN8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NDN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A6NDN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A6NDN8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A6NDN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A6NDN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A6NDN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NDN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms