Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMNCA6NCL1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms