Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC66A2RUB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms