Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPDC1A2A3K4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPDC1A2A3K4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms