Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC26A0AVF1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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