Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ72 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PQ72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQ72 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQ72 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms