Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms