Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms