Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM35Q9UPQ4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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