Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms