Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF346Q9UL40 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms