Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms