Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FBXL4Q9UKA2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms