Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms