Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REV1Q9UBZ9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms