Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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COPS7AQ9UBW8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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COPS7AQ9UBW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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COPS7AQ9UBW8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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