Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK-18Q9QC07 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms