Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms