Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC180Q9P1Z9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms